Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms