Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFIP1P53367 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms