Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms