Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEK4P51957 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEK4P51957 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEK4P51957 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEK4P51957 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEK4P51957 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEK4P51957 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEK4P51957 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEK4P51957 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEK4P51957 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEK4P51957 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEK4P51957 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEK4P51957 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NEK4P51957 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEK4P51957 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEK4P51957 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEK4P51957 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEK4P51957 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NEK4P51957 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEK4P51957 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEK4P51957 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEK4P51957 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEK4P51957 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEK4P51957 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEK4P51957 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEK4P51957 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEK4P51957 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEK4P51957 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NEK4P51957 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEK4P51957 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEK4P51957 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEK4P51957 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEK4P51957 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEK4P51957 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEK4P51957 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEK4P51957 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEK4P51957 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEK4P51957 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEK4P51957 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEK4P51957 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEK4P51957 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEK4P51957 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEK4P51957 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEK4P51957 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEK4P51957 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEK4P51957 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEK4P51957 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEK4P51957 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEK4P51957 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEK4P51957 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEK4P51957 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEK4P51957 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEK4P51957 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEK4P51957 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEK4P51957 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEK4P51957 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEK4P51957 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEK4P51957 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEK4P51957 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEK4P51957 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEK4P51957 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEK4P51957 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEK4P51957 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NEK4P51957 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEK4P51957 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEK4P51957 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEK4P51957 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NEK4P51957 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NEK4P51957 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NEK4P51957 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NEK4P51957 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NEK4P51957 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEK4P51957 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEK4P51957 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEK4P51957 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEK4P51957 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEK4P51957 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEK4P51957 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEK4P51957 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEK4P51957 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEK4P51957 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEK4P51957 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEK4P51957 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEK4P51957 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEK4P51957 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEK4P51957 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEK4P51957 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEK4P51957 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEK4P51957 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEK4P51957 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEK4P51957 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEK4P51957 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEK4P51957 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEK4P51957 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEK4P51957 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEK4P51957 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NEK4P51957 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEK4P51957 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEK4P51957 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NEK4P51957 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms