Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BRCA2P51587 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BRCA2P51587 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BRCA2P51587 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BRCA2P51587 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
BRCA2P51587 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BRCA2P51587 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRCA2P51587 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRCA2P51587 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
BRCA2P51587 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BRCA2P51587 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRCA2P51587 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BRCA2P51587 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms