Protein–RNA interactions for Protein: P46109

CRKL, Crk-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRKLP46109 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRKLP46109 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRKLP46109 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRKLP46109 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRKLP46109 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRKLP46109 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRKLP46109 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRKLP46109 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRKLP46109 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRKLP46109 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRKLP46109 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRKLP46109 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRKLP46109 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRKLP46109 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRKLP46109 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRKLP46109 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRKLP46109 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRKLP46109 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRKLP46109 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRKLP46109 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRKLP46109 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CRKLP46109 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRKLP46109 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CRKLP46109 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CRKLP46109 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRKLP46109 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRKLP46109 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRKLP46109 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRKLP46109 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRKLP46109 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRKLP46109 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRKLP46109 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRKLP46109 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRKLP46109 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRKLP46109 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRKLP46109 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRKLP46109 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRKLP46109 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRKLP46109 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRKLP46109 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRKLP46109 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRKLP46109 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRKLP46109 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRKLP46109 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRKLP46109 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRKLP46109 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRKLP46109 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRKLP46109 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRKLP46109 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRKLP46109 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CRKLP46109 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRKLP46109 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CRKLP46109 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CRKLP46109 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRKLP46109 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRKLP46109 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRKLP46109 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CRKLP46109 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRKLP46109 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRKLP46109 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRKLP46109 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRKLP46109 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRKLP46109 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CRKLP46109 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRKLP46109 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRKLP46109 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRKLP46109 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CRKLP46109 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRKLP46109 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CRKLP46109 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRKLP46109 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRKLP46109 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRKLP46109 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CRKLP46109 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CRKLP46109 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRKLP46109 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRKLP46109 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRKLP46109 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRKLP46109 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRKLP46109 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRKLP46109 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRKLP46109 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRKLP46109 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRKLP46109 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRKLP46109 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRKLP46109 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRKLP46109 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRKLP46109 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRKLP46109 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRKLP46109 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CRKLP46109 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRKLP46109 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CRKLP46109 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRKLP46109 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRKLP46109 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRKLP46109 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRKLP46109 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRKLP46109 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRKLP46109 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRKLP46109 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms