Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZEB1P37275 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms