Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms