Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTX2P32243 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTX2P32243 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTX2P32243 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTX2P32243 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTX2P32243 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTX2P32243 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTX2P32243 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTX2P32243 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTX2P32243 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTX2P32243 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTX2P32243 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTX2P32243 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTX2P32243 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTX2P32243 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTX2P32243 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTX2P32243 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTX2P32243 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTX2P32243 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTX2P32243 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTX2P32243 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTX2P32243 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
OTX2P32243 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTX2P32243 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTX2P32243 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTX2P32243 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTX2P32243 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTX2P32243 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTX2P32243 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTX2P32243 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTX2P32243 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
OTX2P32243 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
OTX2P32243 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
OTX2P32243 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
OTX2P32243 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
OTX2P32243 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
OTX2P32243 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
OTX2P32243 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
OTX2P32243 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
OTX2P32243 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
OTX2P32243 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
OTX2P32243 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTX2P32243 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTX2P32243 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTX2P32243 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTX2P32243 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
OTX2P32243 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTX2P32243 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTX2P32243 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTX2P32243 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTX2P32243 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTX2P32243 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTX2P32243 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTX2P32243 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTX2P32243 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTX2P32243 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTX2P32243 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
OTX2P32243 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTX2P32243 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
OTX2P32243 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTX2P32243 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTX2P32243 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTX2P32243 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTX2P32243 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTX2P32243 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTX2P32243 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTX2P32243 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTX2P32243 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTX2P32243 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTX2P32243 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTX2P32243 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTX2P32243 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTX2P32243 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTX2P32243 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTX2P32243 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
OTX2P32243 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTX2P32243 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTX2P32243 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTX2P32243 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTX2P32243 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTX2P32243 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTX2P32243 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTX2P32243 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTX2P32243 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTX2P32243 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTX2P32243 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTX2P32243 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTX2P32243 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTX2P32243 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTX2P32243 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTX2P32243 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTX2P32243 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTX2P32243 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTX2P32243 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTX2P32243 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTX2P32243 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTX2P32243 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTX2P32243 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTX2P32243 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTX2P32243 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms