Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC3AP31941 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC3AP31941 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC3AP31941 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC3AP31941 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC3AP31941 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC3AP31941 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC3AP31941 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC3AP31941 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC3AP31941 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC3AP31941 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC3AP31941 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC3AP31941 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC3AP31941 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC3AP31941 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC3AP31941 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC3AP31941 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC3AP31941 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC3AP31941 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC3AP31941 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC3AP31941 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC3AP31941 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC3AP31941 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOBEC3AP31941 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms