Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 AC080080.2-201ENST00000624307 590 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 AC079336.6-201ENST00000624836 613 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 CDY3P-201ENST00000454543 1618 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 ARHGDIB-201ENST00000228945 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 TIMM23B-201ENST00000374098 1142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 COX7A2L-204ENST00000463055 540 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 AC096751.2-201ENST00000507483 792 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 CU638689.5-201ENST00000623892 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 SLC14A1-203ENST00000415427 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 GSTA2-201ENST00000493422 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms