Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LOXP28300 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LOXP28300 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LOXP28300 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LOXP28300 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LOXP28300 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LOXP28300 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LOXP28300 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LOXP28300 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LOXP28300 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LOXP28300 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LOXP28300 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LOXP28300 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LOXP28300 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LOXP28300 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LOXP28300 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LOXP28300 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LOXP28300 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LOXP28300 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LOXP28300 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LOXP28300 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LOXP28300 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LOXP28300 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LOXP28300 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LOXP28300 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LOXP28300 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LOXP28300 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LOXP28300 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LOXP28300 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LOXP28300 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LOXP28300 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LOXP28300 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LOXP28300 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LOXP28300 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LOXP28300 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LOXP28300 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LOXP28300 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LOXP28300 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LOXP28300 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LOXP28300 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LOXP28300 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LOXP28300 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LOXP28300 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LOXP28300 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LOXP28300 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LOXP28300 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LOXP28300 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LOXP28300 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LOXP28300 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LOXP28300 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LOXP28300 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LOXP28300 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LOXP28300 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LOXP28300 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LOXP28300 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LOXP28300 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LOXP28300 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LOXP28300 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LOXP28300 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LOXP28300 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LOXP28300 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LOXP28300 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LOXP28300 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LOXP28300 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LOXP28300 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LOXP28300 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LOXP28300 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LOXP28300 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LOXP28300 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LOXP28300 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LOXP28300 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LOXP28300 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LOXP28300 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LOXP28300 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LOXP28300 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LOXP28300 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LOXP28300 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LOXP28300 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LOXP28300 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LOXP28300 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LOXP28300 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LOXP28300 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LOXP28300 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LOXP28300 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LOXP28300 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXP28300 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXP28300 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXP28300 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXP28300 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXP28300 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXP28300 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXP28300 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXP28300 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXP28300 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXP28300 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXP28300 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXP28300 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXP28300 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXP28300 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXP28300 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms