Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms