Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms