Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms