Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC30■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
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