Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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