Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms