Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms