Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms