Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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RAB4AP20338 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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RAB4AP20338 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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RAB4AP20338 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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RAB4AP20338 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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RAB4AP20338 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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RAB4AP20338 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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RAB4AP20338 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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RAB4AP20338 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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RAB4AP20338 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB4AP20338 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB4AP20338 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB4AP20338 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB4AP20338 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB4AP20338 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB4AP20338 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB4AP20338 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB4AP20338 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB4AP20338 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB4AP20338 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB4AP20338 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB4AP20338 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB4AP20338 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB4AP20338 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB4AP20338 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB4AP20338 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB4AP20338 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB4AP20338 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB4AP20338 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB4AP20338 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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