Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LIG1P18858 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LIG1P18858 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LIG1P18858 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LIG1P18858 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LIG1P18858 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LIG1P18858 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LIG1P18858 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LIG1P18858 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LIG1P18858 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LIG1P18858 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIG1P18858 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIG1P18858 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIG1P18858 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIG1P18858 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIG1P18858 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIG1P18858 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIG1P18858 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIG1P18858 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIG1P18858 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIG1P18858 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIG1P18858 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIG1P18858 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIG1P18858 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIG1P18858 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LIG1P18858 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIG1P18858 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LIG1P18858 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIG1P18858 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIG1P18858 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIG1P18858 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIG1P18858 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIG1P18858 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIG1P18858 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIG1P18858 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LIG1P18858 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LIG1P18858 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LIG1P18858 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LIG1P18858 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LIG1P18858 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LIG1P18858 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LIG1P18858 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LIG1P18858 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LIG1P18858 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LIG1P18858 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LIG1P18858 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LIG1P18858 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LIG1P18858 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LIG1P18858 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LIG1P18858 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LIG1P18858 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LIG1P18858 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LIG1P18858 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LIG1P18858 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LIG1P18858 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LIG1P18858 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LIG1P18858 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LIG1P18858 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LIG1P18858 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIG1P18858 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LIG1P18858 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIG1P18858 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIG1P18858 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIG1P18858 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIG1P18858 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIG1P18858 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIG1P18858 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIG1P18858 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIG1P18858 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIG1P18858 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIG1P18858 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIG1P18858 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIG1P18858 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIG1P18858 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIG1P18858 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIG1P18858 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIG1P18858 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIG1P18858 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIG1P18858 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIG1P18858 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIG1P18858 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIG1P18858 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIG1P18858 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIG1P18858 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIG1P18858 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIG1P18858 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIG1P18858 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LIG1P18858 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIG1P18858 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIG1P18858 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIG1P18858 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LIG1P18858 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIG1P18858 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIG1P18858 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIG1P18858 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIG1P18858 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIG1P18858 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIG1P18858 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIG1P18858 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIG1P18858 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms