Protein–RNA interactions for Protein: P17948

FLT1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT1P17948 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FLT1P17948 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FLT1P17948 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FLT1P17948 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FLT1P17948 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FLT1P17948 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FLT1P17948 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FLT1P17948 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FLT1P17948 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FLT1P17948 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FLT1P17948 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FLT1P17948 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FLT1P17948 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FLT1P17948 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FLT1P17948 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FLT1P17948 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FLT1P17948 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FLT1P17948 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FLT1P17948 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FLT1P17948 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FLT1P17948 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FLT1P17948 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FLT1P17948 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FLT1P17948 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FLT1P17948 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FLT1P17948 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FLT1P17948 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FLT1P17948 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FLT1P17948 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FLT1P17948 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FLT1P17948 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FLT1P17948 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FLT1P17948 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FLT1P17948 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FLT1P17948 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FLT1P17948 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FLT1P17948 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FLT1P17948 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FLT1P17948 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FLT1P17948 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FLT1P17948 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FLT1P17948 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FLT1P17948 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FLT1P17948 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FLT1P17948 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FLT1P17948 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FLT1P17948 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FLT1P17948 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FLT1P17948 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FLT1P17948 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FLT1P17948 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FLT1P17948 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FLT1P17948 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FLT1P17948 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FLT1P17948 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FLT1P17948 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FLT1P17948 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FLT1P17948 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FLT1P17948 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FLT1P17948 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FLT1P17948 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FLT1P17948 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FLT1P17948 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FLT1P17948 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FLT1P17948 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FLT1P17948 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FLT1P17948 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FLT1P17948 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FLT1P17948 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FLT1P17948 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FLT1P17948 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FLT1P17948 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FLT1P17948 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FLT1P17948 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FLT1P17948 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FLT1P17948 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FLT1P17948 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FLT1P17948 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FLT1P17948 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FLT1P17948 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FLT1P17948 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FLT1P17948 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FLT1P17948 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FLT1P17948 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FLT1P17948 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FLT1P17948 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FLT1P17948 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FLT1P17948 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FLT1P17948 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FLT1P17948 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FLT1P17948 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FLT1P17948 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FLT1P17948 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FLT1P17948 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FLT1P17948 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FLT1P17948 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FLT1P17948 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FLT1P17948 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FLT1P17948 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FLT1P17948 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms