Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
COL6A2P12110 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms