Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HKR1P10072 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HKR1P10072 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HKR1P10072 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HKR1P10072 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HKR1P10072 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HKR1P10072 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HKR1P10072 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HKR1P10072 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HKR1P10072 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HKR1P10072 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HKR1P10072 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HKR1P10072 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HKR1P10072 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HKR1P10072 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HKR1P10072 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HKR1P10072 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HKR1P10072 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HKR1P10072 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HKR1P10072 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HKR1P10072 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HKR1P10072 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HKR1P10072 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HKR1P10072 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HKR1P10072 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HKR1P10072 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HKR1P10072 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HKR1P10072 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HKR1P10072 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HKR1P10072 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HKR1P10072 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HKR1P10072 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HKR1P10072 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HKR1P10072 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HKR1P10072 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HKR1P10072 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
HKR1P10072 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
HKR1P10072 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HKR1P10072 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HKR1P10072 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HKR1P10072 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HKR1P10072 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HKR1P10072 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HKR1P10072 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HKR1P10072 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HKR1P10072 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HKR1P10072 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HKR1P10072 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HKR1P10072 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HKR1P10072 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HKR1P10072 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HKR1P10072 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HKR1P10072 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HKR1P10072 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HKR1P10072 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HKR1P10072 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HKR1P10072 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HKR1P10072 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HKR1P10072 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HKR1P10072 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HKR1P10072 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HKR1P10072 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HKR1P10072 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HKR1P10072 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HKR1P10072 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HKR1P10072 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HKR1P10072 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HKR1P10072 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HKR1P10072 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HKR1P10072 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HKR1P10072 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HKR1P10072 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HKR1P10072 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HKR1P10072 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HKR1P10072 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HKR1P10072 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HKR1P10072 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HKR1P10072 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HKR1P10072 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HKR1P10072 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HKR1P10072 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HKR1P10072 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HKR1P10072 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HKR1P10072 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HKR1P10072 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HKR1P10072 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HKR1P10072 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HKR1P10072 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HKR1P10072 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HKR1P10072 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HKR1P10072 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HKR1P10072 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HKR1P10072 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HKR1P10072 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HKR1P10072 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HKR1P10072 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HKR1P10072 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HKR1P10072 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HKR1P10072 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HKR1P10072 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms