Protein–RNA interactions for Protein: P0DP23

CALM1, Calmodulin-1, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM1P0DP23 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CALM1P0DP23 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms