Protein–RNA interactions for Protein: P0DP01

IGHV1-8, Immunoglobulin heavy variable 1-8, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV1-8P0DP01 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV1-8P0DP01 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms