Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
C8orf89P0DMQ9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf89P0DMQ9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf89P0DMQ9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf89P0DMQ9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf89P0DMQ9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf89P0DMQ9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf89P0DMQ9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf89P0DMQ9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf89P0DMQ9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf89P0DMQ9 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf89P0DMQ9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf89P0DMQ9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf89P0DMQ9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf89P0DMQ9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf89P0DMQ9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf89P0DMQ9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf89P0DMQ9 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf89P0DMQ9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf89P0DMQ9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf89P0DMQ9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms