Protein–RNA interactions for Protein: P0CG33

GOLGA6D, Golgin subfamily A member 6D, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6DP0CG33 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6DP0CG33 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6DP0CG33 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6DP0CG33 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6DP0CG33 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6DP0CG33 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6DP0CG33 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6DP0CG33 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6DP0CG33 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6DP0CG33 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6DP0CG33 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6DP0CG33 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6DP0CG33 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6DP0CG33 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6DP0CG33 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6DP0CG33 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6DP0CG33 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6DP0CG33 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6DP0CG33 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6DP0CG33 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6DP0CG33 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6DP0CG33 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6DP0CG33 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6DP0CG33 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6DP0CG33 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6DP0CG33 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6DP0CG33 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6DP0CG33 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6DP0CG33 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6DP0CG33 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6DP0CG33 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6DP0CG33 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GOLGA6DP0CG33 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GOLGA6DP0CG33 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GOLGA6DP0CG33 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6DP0CG33 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms