Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC172P0C7W6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC172P0C7W6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC172P0C7W6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC172P0C7W6 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC172P0C7W6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC172P0C7W6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms