Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VIL1P09327 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VIL1P09327 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VIL1P09327 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VIL1P09327 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VIL1P09327 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VIL1P09327 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VIL1P09327 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VIL1P09327 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VIL1P09327 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VIL1P09327 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VIL1P09327 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VIL1P09327 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VIL1P09327 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VIL1P09327 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VIL1P09327 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VIL1P09327 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VIL1P09327 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VIL1P09327 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VIL1P09327 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VIL1P09327 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VIL1P09327 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VIL1P09327 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VIL1P09327 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VIL1P09327 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VIL1P09327 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VIL1P09327 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VIL1P09327 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VIL1P09327 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VIL1P09327 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VIL1P09327 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VIL1P09327 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VIL1P09327 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VIL1P09327 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VIL1P09327 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VIL1P09327 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VIL1P09327 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VIL1P09327 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VIL1P09327 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VIL1P09327 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VIL1P09327 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VIL1P09327 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VIL1P09327 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VIL1P09327 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VIL1P09327 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VIL1P09327 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VIL1P09327 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VIL1P09327 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VIL1P09327 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VIL1P09327 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VIL1P09327 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VIL1P09327 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VIL1P09327 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VIL1P09327 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VIL1P09327 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VIL1P09327 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VIL1P09327 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VIL1P09327 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VIL1P09327 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VIL1P09327 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VIL1P09327 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VIL1P09327 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VIL1P09327 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VIL1P09327 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VIL1P09327 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VIL1P09327 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VIL1P09327 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VIL1P09327 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VIL1P09327 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VIL1P09327 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VIL1P09327 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VIL1P09327 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VIL1P09327 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VIL1P09327 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VIL1P09327 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VIL1P09327 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VIL1P09327 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VIL1P09327 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VIL1P09327 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VIL1P09327 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VIL1P09327 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VIL1P09327 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIL1P09327 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIL1P09327 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIL1P09327 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIL1P09327 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIL1P09327 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIL1P09327 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VIL1P09327 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIL1P09327 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIL1P09327 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIL1P09327 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIL1P09327 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VIL1P09327 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIL1P09327 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VIL1P09327 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIL1P09327 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIL1P09327 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VIL1P09327 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VIL1P09327 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms