Protein–RNA interactions for Protein: P05452

CLEC3B, Tetranectin, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC3BP05452 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLEC3BP05452 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLEC3BP05452 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLEC3BP05452 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLEC3BP05452 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CLEC3BP05452 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLEC3BP05452 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLEC3BP05452 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLEC3BP05452 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLEC3BP05452 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLEC3BP05452 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLEC3BP05452 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLEC3BP05452 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLEC3BP05452 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CLEC3BP05452 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLEC3BP05452 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLEC3BP05452 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLEC3BP05452 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLEC3BP05452 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLEC3BP05452 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLEC3BP05452 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLEC3BP05452 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLEC3BP05452 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLEC3BP05452 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLEC3BP05452 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLEC3BP05452 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLEC3BP05452 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLEC3BP05452 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLEC3BP05452 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLEC3BP05452 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CLEC3BP05452 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLEC3BP05452 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLEC3BP05452 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLEC3BP05452 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLEC3BP05452 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CLEC3BP05452 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC3BP05452 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC3BP05452 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC3BP05452 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC3BP05452 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC3BP05452 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC3BP05452 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC3BP05452 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC3BP05452 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC3BP05452 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC3BP05452 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC3BP05452 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC3BP05452 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC3BP05452 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC3BP05452 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC3BP05452 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC3BP05452 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC3BP05452 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC3BP05452 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLEC3BP05452 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC3BP05452 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC3BP05452 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLEC3BP05452 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC3BP05452 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLEC3BP05452 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC3BP05452 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLEC3BP05452 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC3BP05452 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC3BP05452 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC3BP05452 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC3BP05452 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLEC3BP05452 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC3BP05452 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC3BP05452 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC3BP05452 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC3BP05452 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC3BP05452 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC3BP05452 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC3BP05452 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC3BP05452 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC3BP05452 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC3BP05452 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC3BP05452 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC3BP05452 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC3BP05452 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC3BP05452 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC3BP05452 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC3BP05452 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC3BP05452 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC3BP05452 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC3BP05452 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC3BP05452 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC3BP05452 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC3BP05452 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC3BP05452 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC3BP05452 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC3BP05452 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC3BP05452 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC3BP05452 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC3BP05452 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC3BP05452 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC3BP05452 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC3BP05452 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC3BP05452 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC3BP05452 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms