Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NSD2O96028 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NSD2O96028 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NSD2O96028 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NSD2O96028 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NSD2O96028 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NSD2O96028 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NSD2O96028 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NSD2O96028 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NSD2O96028 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NSD2O96028 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NSD2O96028 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NSD2O96028 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NSD2O96028 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NSD2O96028 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NSD2O96028 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NSD2O96028 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NSD2O96028 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NSD2O96028 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NSD2O96028 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NSD2O96028 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NSD2O96028 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NSD2O96028 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NSD2O96028 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NSD2O96028 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NSD2O96028 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NSD2O96028 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NSD2O96028 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NSD2O96028 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NSD2O96028 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NSD2O96028 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NSD2O96028 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NSD2O96028 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NSD2O96028 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NSD2O96028 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NSD2O96028 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NSD2O96028 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NSD2O96028 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NSD2O96028 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NSD2O96028 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NSD2O96028 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NSD2O96028 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NSD2O96028 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NSD2O96028 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
NSD2O96028 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
NSD2O96028 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NSD2O96028 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NSD2O96028 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NSD2O96028 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NSD2O96028 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NSD2O96028 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NSD2O96028 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NSD2O96028 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NSD2O96028 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NSD2O96028 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NSD2O96028 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NSD2O96028 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NSD2O96028 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NSD2O96028 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NSD2O96028 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NSD2O96028 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NSD2O96028 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NSD2O96028 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NSD2O96028 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NSD2O96028 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NSD2O96028 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NSD2O96028 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NSD2O96028 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NSD2O96028 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NSD2O96028 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NSD2O96028 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NSD2O96028 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NSD2O96028 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NSD2O96028 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NSD2O96028 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NSD2O96028 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NSD2O96028 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NSD2O96028 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NSD2O96028 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NSD2O96028 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NSD2O96028 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NSD2O96028 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NSD2O96028 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NSD2O96028 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NSD2O96028 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NSD2O96028 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NSD2O96028 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NSD2O96028 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NSD2O96028 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NSD2O96028 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NSD2O96028 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NSD2O96028 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NSD2O96028 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NSD2O96028 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NSD2O96028 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NSD2O96028 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NSD2O96028 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NSD2O96028 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NSD2O96028 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NSD2O96028 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms