Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX7O95931 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX7O95931 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX7O95931 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX7O95931 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX7O95931 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX7O95931 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX7O95931 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX7O95931 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX7O95931 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX7O95931 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX7O95931 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX7O95931 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX7O95931 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX7O95931 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX7O95931 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX7O95931 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX7O95931 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX7O95931 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX7O95931 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX7O95931 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX7O95931 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX7O95931 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX7O95931 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX7O95931 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX7O95931 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX7O95931 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX7O95931 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX7O95931 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX7O95931 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX7O95931 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX7O95931 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX7O95931 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX7O95931 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX7O95931 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX7O95931 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX7O95931 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX7O95931 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX7O95931 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX7O95931 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX7O95931 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX7O95931 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX7O95931 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX7O95931 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX7O95931 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX7O95931 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX7O95931 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX7O95931 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX7O95931 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX7O95931 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX7O95931 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX7O95931 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX7O95931 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX7O95931 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX7O95931 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX7O95931 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX7O95931 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX7O95931 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX7O95931 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX7O95931 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX7O95931 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX7O95931 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX7O95931 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX7O95931 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX7O95931 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX7O95931 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX7O95931 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX7O95931 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX7O95931 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX7O95931 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX7O95931 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX7O95931 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX7O95931 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX7O95931 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX7O95931 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX7O95931 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX7O95931 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX7O95931 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX7O95931 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX7O95931 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX7O95931 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX7O95931 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX7O95931 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX7O95931 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX7O95931 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX7O95931 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX7O95931 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX7O95931 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX7O95931 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX7O95931 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX7O95931 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX7O95931 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX7O95931 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX7O95931 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX7O95931 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX7O95931 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX7O95931 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX7O95931 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX7O95931 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX7O95931 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms