Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POP4O95707 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POP4O95707 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POP4O95707 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POP4O95707 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POP4O95707 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POP4O95707 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POP4O95707 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POP4O95707 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
POP4O95707 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POP4O95707 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POP4O95707 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POP4O95707 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POP4O95707 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
POP4O95707 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POP4O95707 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
POP4O95707 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
POP4O95707 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POP4O95707 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POP4O95707 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POP4O95707 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POP4O95707 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POP4O95707 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POP4O95707 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POP4O95707 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POP4O95707 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POP4O95707 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POP4O95707 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POP4O95707 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POP4O95707 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
POP4O95707 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POP4O95707 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POP4O95707 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POP4O95707 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POP4O95707 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
POP4O95707 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POP4O95707 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POP4O95707 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POP4O95707 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POP4O95707 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
POP4O95707 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POP4O95707 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
POP4O95707 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POP4O95707 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POP4O95707 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
POP4O95707 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POP4O95707 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POP4O95707 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POP4O95707 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POP4O95707 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POP4O95707 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POP4O95707 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POP4O95707 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POP4O95707 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POP4O95707 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POP4O95707 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POP4O95707 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POP4O95707 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POP4O95707 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POP4O95707 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POP4O95707 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POP4O95707 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POP4O95707 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POP4O95707 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
POP4O95707 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POP4O95707 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POP4O95707 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POP4O95707 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POP4O95707 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POP4O95707 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POP4O95707 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POP4O95707 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POP4O95707 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POP4O95707 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POP4O95707 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POP4O95707 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POP4O95707 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POP4O95707 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POP4O95707 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POP4O95707 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POP4O95707 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POP4O95707 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POP4O95707 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POP4O95707 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POP4O95707 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
POP4O95707 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
POP4O95707 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POP4O95707 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POP4O95707 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POP4O95707 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POP4O95707 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POP4O95707 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POP4O95707 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POP4O95707 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POP4O95707 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POP4O95707 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POP4O95707 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POP4O95707 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POP4O95707 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POP4O95707 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms