Protein–RNA interactions for Protein: O94889

KLHL18, Kelch-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL18O94889 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms