Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UFL1O94874 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UFL1O94874 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UFL1O94874 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UFL1O94874 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UFL1O94874 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UFL1O94874 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UFL1O94874 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UFL1O94874 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
UFL1O94874 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UFL1O94874 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UFL1O94874 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UFL1O94874 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UFL1O94874 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UFL1O94874 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
UFL1O94874 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UFL1O94874 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UFL1O94874 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UFL1O94874 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UFL1O94874 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UFL1O94874 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UFL1O94874 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UFL1O94874 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UFL1O94874 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UFL1O94874 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UFL1O94874 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UFL1O94874 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UFL1O94874 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UFL1O94874 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UFL1O94874 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UFL1O94874 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UFL1O94874 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UFL1O94874 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UFL1O94874 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UFL1O94874 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UFL1O94874 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UFL1O94874 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UFL1O94874 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UFL1O94874 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UFL1O94874 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UFL1O94874 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UFL1O94874 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UFL1O94874 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UFL1O94874 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UFL1O94874 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UFL1O94874 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UFL1O94874 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UFL1O94874 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
UFL1O94874 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UFL1O94874 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
UFL1O94874 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UFL1O94874 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UFL1O94874 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UFL1O94874 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UFL1O94874 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UFL1O94874 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UFL1O94874 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UFL1O94874 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UFL1O94874 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UFL1O94874 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UFL1O94874 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UFL1O94874 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UFL1O94874 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UFL1O94874 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UFL1O94874 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UFL1O94874 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UFL1O94874 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UFL1O94874 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UFL1O94874 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UFL1O94874 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UFL1O94874 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UFL1O94874 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UFL1O94874 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
UFL1O94874 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UFL1O94874 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UFL1O94874 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UFL1O94874 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UFL1O94874 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UFL1O94874 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UFL1O94874 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UFL1O94874 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UFL1O94874 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UFL1O94874 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UFL1O94874 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UFL1O94874 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UFL1O94874 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UFL1O94874 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
UFL1O94874 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UFL1O94874 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UFL1O94874 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UFL1O94874 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UFL1O94874 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UFL1O94874 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UFL1O94874 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UFL1O94874 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UFL1O94874 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UFL1O94874 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UFL1O94874 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UFL1O94874 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UFL1O94874 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms