Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms