Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAB11FIP3O75154 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms