Protein–RNA interactions for Protein: O60312

ATP10A, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP10AO60312 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP10AO60312 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms