Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP2AO43633 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP2AO43633 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP2AO43633 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP2AO43633 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP2AO43633 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP2AO43633 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP2AO43633 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP2AO43633 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP2AO43633 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP2AO43633 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP2AO43633 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP2AO43633 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP2AO43633 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP2AO43633 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP2AO43633 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP2AO43633 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP2AO43633 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP2AO43633 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP2AO43633 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP2AO43633 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP2AO43633 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CHMP2AO43633 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms