Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms