Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms