Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAPO00193 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAPO00193 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAPO00193 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAPO00193 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAPO00193 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAPO00193 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAPO00193 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAPO00193 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAPO00193 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAPO00193 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAPO00193 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAPO00193 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAPO00193 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAPO00193 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAPO00193 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAPO00193 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAPO00193 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAPO00193 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAPO00193 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAPO00193 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAPO00193 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAPO00193 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAPO00193 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAPO00193 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAPO00193 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAPO00193 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAPO00193 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAPO00193 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAPO00193 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMAPO00193 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMAPO00193 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMAPO00193 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMAPO00193 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMAPO00193 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMAPO00193 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMAPO00193 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMAPO00193 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMAPO00193 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMAPO00193 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMAPO00193 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMAPO00193 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SMAPO00193 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMAPO00193 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMAPO00193 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMAPO00193 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMAPO00193 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMAPO00193 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMAPO00193 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMAPO00193 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMAPO00193 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMAPO00193 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMAPO00193 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMAPO00193 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMAPO00193 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMAPO00193 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMAPO00193 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMAPO00193 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMAPO00193 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMAPO00193 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMAPO00193 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMAPO00193 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMAPO00193 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMAPO00193 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMAPO00193 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMAPO00193 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMAPO00193 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMAPO00193 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMAPO00193 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMAPO00193 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMAPO00193 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMAPO00193 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMAPO00193 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMAPO00193 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMAPO00193 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMAPO00193 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMAPO00193 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMAPO00193 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMAPO00193 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMAPO00193 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMAPO00193 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMAPO00193 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMAPO00193 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.7
SMAPO00193 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMAPO00193 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMAPO00193 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMAPO00193 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMAPO00193 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMAPO00193 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMAPO00193 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMAPO00193 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMAPO00193 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMAPO00193 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMAPO00193 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMAPO00193 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMAPO00193 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMAPO00193 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMAPO00193 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMAPO00193 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMAPO00193 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms