Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms