Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms