Protein–RNA interactions for Protein: A6PVI3

NCBP2L, Nuclear cap-binding protein subunit 2-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP2LA6PVI3 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms