Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms