Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PALM3A6NDB9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms