Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms